在阿里云备案的网站可以使用百度云的服务器么？

不可以。

网站备案是指域名和服务器绑定在一起使用的备案登记，当你更换服务器提供商时，也就解除了域名和服务器（服务器提供的服务商）的关系，需要在新的服务器提供商重新接入备案（和重新备案流程上没有区别，只是备案变更接入期间，网站一般可以正常使用）。